Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LSAMPQ13449 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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