Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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