Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXO1Q12778 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXO1Q12778 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXO1Q12778 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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