Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms