Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms