Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PAX8Q06710 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PAX8Q06710 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms