Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN12Q05209 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms