Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms