Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CDK3Q00526 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms