Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.1 ms