Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLE2P56282 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLE2P56282 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLE2P56282 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLE2P56282 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms