Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2A2P52657 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms