Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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