Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms