Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms