Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms