Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF8Q9UPP1 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms