Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms