Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TBCCD1Q9NVR7 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms