Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms