Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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