Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSPRY1Q96DX4 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms