Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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