Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN23Q96B33 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN23Q96B33 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN23Q96B33 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN23Q96B33 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN23Q96B33 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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