Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms