Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DUPD1Q68J44 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms