Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKDCCQ504Y2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms