Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms