Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF1AQ15573 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF1AQ15573 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF1AQ15573 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF1AQ15573 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF1AQ15573 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF1AQ15573 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TAF1AQ15573 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms