Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms