Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA3AQ14563 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms