Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms