Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COX10Q12887 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COX10Q12887 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COX10Q12887 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COX10Q12887 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COX10Q12887 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COX10Q12887 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COX10Q12887 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COX10Q12887 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
COX10Q12887 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COX10Q12887 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COX10Q12887 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COX10Q12887 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
COX10Q12887 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COX10Q12887 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COX10Q12887 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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