Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSRP1Q08945 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms