Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms