Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms