Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms