Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms