Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB4P54760 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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