Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPREP23469 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPREP23469 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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