Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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NFKB1P19838 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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NFKB1P19838 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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NFKB1P19838 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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