Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms