Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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