Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms