Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms