Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVK-18Q9QC07 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms