Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSPG4P5Q96PW8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms