Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTV1Q96GA3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms