Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms