Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD2Q92925 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms